Projecten per jaar
Persoonlijk profiel
Opleiding/academische kwalificatie
ingenieur moleculaire wetenschappen
doctoraat moleculaire biologie
Doctor ingenieur
Vlaamse Disciplinelijst
- Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases
- Moleculaire en celbiologie niet elders geclassificeerd
- Genomics
- Celgroei en -ontwikkeling
- Microbiomen
- Genoomstructuur en -regulatie
- Cel- en moleculaire biologie van planten
- Andere biotechnologie, bio-en biosysteem ingenieurswetenschappen niet elders geclassificeerd
- Computationele evolutionaire biologie, comparatieve genomics en populatiegenomics
- Ontwikkelings- en reproductieve biologie van planten
- Computationele transcriptomics en epigenomics
- Kweken en biotechnologie van landbouwgewassen
Vingerafdruk
- 1 Vergelijkbare profielen
Netwerk
-
GENEBECON: Benutten van het potentieel van 'Gene editing' in kader van een duurzame bio-economie.
Van Laere, K., De Loose, M., Delezie, E., Herman, L., Ruttink, T., Robbens, J., Allaert, S., Vereecke, E., Van Nerom, S., Mingolla, C., Claeys, B., Hostens, K., Leleu, S., Losschaert, M., Vander Linden, J., De Picker, R., Carbonelle, S., De Craecker, M., De Grande, A., Lourenço Ribeiro Alves, M., Degrave, Y., Luyckx, W., Casciaro, V., De Backer, F., Van Havermaet, A. & Van Noten, N.
1/09/22 → 31/08/25
Project: Onderzoek
-
CENH3-CHIC: Creatie van CENH3 haploïd inducer lijnen en transcriptoomstudie van CMS stabiliteit in Cichorium intybus
Eeckhaut, T., Baert, J., Ruttink, T., Van Laere, K. & Waegneer, E.
1/10/19 → 30/09/23
Project: Onderzoek
-
FWO-CANEPHORA: Effecten van verstoring van het tropische regenwoud op de uitwisseling van genetisch materiaal, genomische diversiteit en introgressie bij bomen in de onder-etage: Het geval van Coffea canephora (Robustakoffie) in het Congo-bassin
Ruttink, T., Roldán-Ruiz, I., Verleysen, L. & Quataert, P.
1/01/19 → 31/12/23
Project: Onderzoek
-
BREED4KELP2FEED: Veredeling van kelp voor efficiënt en duurzaam gebruik van mariene bronnen
1/05/18 → 1/04/23
Project: Onderzoek
-
BREEDIT: a multiplex genome editing strategy to improve complex quantitative traits in maize
Lorenzo, C. D., Debray, K., Herwegh, D., Develtere, W., Impens, L., Schaumont, D., Vandeputte, W., Aesaert, S., Coussens, G., De Boe, Y., Demuynck, K., Van Hautegem, T., Pauwels, L., Jacobs, T. B., Ruttink, T., Nelissen, H. & Inzé, D., 2-jan-2023, In: Plant Cell. 35, 1, blz. 218-238 21 blz.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review
-
Genetic diversity and structure in wild Robusta coffee (Coffea canephora A. Froehner) populations in Yangambi (DR Congo) and their relation to forest disturbance
Depecker, J., Verleysen, L., Asimonyio, J. A., Hatangi, Y., Kambale, J-L., Mwanga Mwanga, I., Ebele, T., Dhed'a, B., Bawin, Y., Staelens, A., Stoffelen, P., Ruttink, T., Vandelook, F. & Honnay, O., 3-jan-2023, In: Heredity. 130, 3, blz. 145-153 9 blz.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review
-
Multi-location trials and population-based genotyping reveal high diversity and adaptation to breeding environments in a large collection of red clover
Nay, M. M., Grieder, C., Frey, L. A., Amdahl, H., Radovic, J., Jaluvka, L., Palmé, A., Skøt, L., Ruttink, T. & Kölliker, R., 1-mrt-2023, In: Frontiers in Plant Science. 14, 1128823.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review
Open Access -
SMAP design: a multiplex PCR amplicon and gRNA design tool to screen for natural and CRISPR-induced genetic variation
Develtere, W., Waegneer, E., Debray, K., De Saeger, J., Van Glabeke, S., Maere, S., Ruttink, T. & Jacobs, T. B., 31-jan-2023, (E-publicatie voorafgaand op geprinte versie) In: Nucleic acids research. gkad036.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review
Open Access -
Assessing biodiversity using high-throughput sequencing to monitor plant and soil health
Haegeman, A., Bonte, J., Debode, J., De Jonghe, K., Dermauw, W., De Tender, C., Ebrahimi, N., Heungens, K., Ruttink, T., Slos, D., Van Poucke, K., Waeyenberge, L. & Witters, J., 24-mei-2022.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan congres › Poster
Open AccessBestand6 Downloads (Pure)
Datasets
-
Phenotypic variation and quantitative trait loci for resistance to southern anthracnose and clover rot in red clover
Pégard, M. (Bijdrager), Grieder, C. (Bijdrager), Skøt, L. (Bijdrager), Vleugels, T. (Bijdrager), Roldán-Ruiz, I. (Bijdrager), Ruttink, T. (Bijdrager), Schubiger, F. X. (Bijdrager), Frey, L. A. (Bijdrager), Studer, B. (Bijdrager) & Kölliker, R. (Bijdrager), Zenodo, 23-mei-2022
DOI: 10.5281/zenodo.6572010, https://zenodo.org/api/records/6572010
Dataset
-
Supplementary information accompanying the paper "Nematodes facilitate bacterial-mediated biogeochemical processes in marine sediments: a meta-transcriptomics approach"
Guden, R. M. (Bijdrager), Haegeman, A. (Bijdrager), Ruttink, T. (Bijdrager), Moens, T. (Bijdrager), Derycke, S. (Bijdrager), Marine Biology Research Group-UGent, B. (Bijdrager) & Institute For Agricultural And Fisheries Research-Flemish Government, B. (Bijdrager), VLIZ-Vlaams Instituut voor de Zee, 1-jan-2022
DOI: 10.14284/575, https://www.vliz.be/en/imis%3Fdasid=8116&doiid=732
Dataset
-
Orthology guided transcriptome assembly of Italian ryegrass and meadow fescue for single nucleotide polymorphisms discovery (data set)
Steven, Y. (Bijdrager), Tomasz, K. (Bijdrager), David, K. (Bijdrager), Jan, B. (Bijdrager), Bruno, S. (Bijdrager), Michael, A. (Bijdrager), Roldán-Ruiz, I. (Bijdrager), Zbigniew, Z. (Bijdrager), Elodie, R. (Bijdrager), Jaroslav, D. (Bijdrager), Stepan, S. (Bijdrager) & Ruttink, T. (Bijdrager), Zenodo, 10-feb-2016
DOI: 10.5281/zenodo.45855, https://zenodo.org/api/records/45855
Dataset
-
Orthology guided transcriptome assembly of Italian ryegrass and meadow fescue (update data set)
Steven, Y. (Bijdrager), Tomasz, K. (Bijdrager), David, K. (Bijdrager), Jan, B. (Bijdrager), Bruno, S. (Bijdrager), Michael, A. (Bijdrager), Roldán-Ruiz, I. (Bijdrager), Zbigniew, Z. (Bijdrager), Elodie, R. (Bijdrager), Jaroslav, D. (Bijdrager), Ruttink, T. (Bijdrager) & Stoces, S. (Bijdrager), Zenodo, 10-jun-2016
DOI: 10.5281/zenodo.55304, https://zenodo.org/api/records/55304
Dataset
-
Data from: Unravelling hybridization in Phytophthora using phylogenomics and genome size estimation
Van Poucke, K. (Bijdrager), Haegeman, A. (Bijdrager), Goedefroit, T. (Bijdrager), Focquet, F. (Bijdrager), Leus, L. (Bijdrager), Horta Jung, M. (Bijdrager), Junker, C. (Bijdrager), Redondo, M. (Bijdrager), Husson, C. (Bijdrager), Kostov, K. (Bijdrager), Lyubenova, A. (Bijdrager), Christova, P. (Bijdrager), Chandelier, A. (Bijdrager), Slavov, S. (Bijdrager), De Cock, A. (Bijdrager), Bonants, P. (Bijdrager), Werres, S. (Bijdrager), Palau, J. (Bijdrager), Marçais, B. (Bijdrager), Jung, T. (Bijdrager), Stenlid, J. (Bijdrager), Ruttink, T. (Bijdrager) & Heungens, K. (Bijdrager), Dryad, 1-jan-2019
DOI: 10.5061/dryad.p40r314, http://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061/dryad.p40r314
Dataset
Activiteiten
-
Novel approaches in phylogenomics reveal extensive interspecific hybridization and polyploidization in the Genus Phytophthora
Tom Ruttink (Spreker op uitnodiging)
12-jan-2020Activiteit: Gesprek of presentatie › Lezing en mondelinge bijdrage
-
ELIXIR Belgium All Hands meeting
Tom Ruttink (Deelnemer)
16-sep-2019Activiteit: Deelnemen aan een evenement of er een organiseren › Organisatie en deelname aan een congres
-
GFPI Sommertagung der Abteilung Futterpflanzen
Joost Baert (Co-organisator), Tim Vleugels (Spreker), Tom Ruttink (Spreker), Hilde Muylle (Spreker) & Irene Borra Serrano (Spreker)
10-apr-2019 → 11-apr-2019Activiteit: Deelnemen aan een evenement of er een organiseren › Organisatie en deelname aan een workshop, opleiding, seminarie
Bestand -
Elixir Training Workshop. Research Data Management & Data Stewardship: more than a FAIRytale
Tom Ruttink (Deelnemer)
12-dec-2019Activiteit: Deelnemen aan een evenement of er een organiseren › Organisatie en deelname aan een workshop, opleiding, seminarie
-
Unraveling hybridization in the genus Phytophthora using phylogenomics and genome size estimation
Tom Ruttink (Spreker op uitnodiging)
14-jun-2019Activiteit: Gesprek of presentatie › Lezing en mondelinge bijdrage