Het gebruik van proteomics in dierwetenschappelijk onderzoek

Algemeen kader

Er bestaat voortaan een geoptimaliseerde en reproduceerbare methodologie voor massaspectrometrie-gebaseerde proteomics van de intestinale mucosa bij varkens. Daar hoort ook een gefinaliseerd protocol bij dat al een eerste keer in een experiment succesvol is toegepast. Het verbeteren van de darmgezondheid van varkens staat centraal in het verbeteren van de productiviteit, het dierenwelzijn en de duurzaamheid binnen moderne veehouderijsystemen. De intestinale mucosa is cruciaal bij verschillende fysiologische processen, waaronder nutriëntabsorptie, immuunfunctie en complexe interacties tussen gastheer en microben. Massaspectrometrie-gebaseerde proteomics biedt een krachtig hulpmiddel om de moleculaire onderliggende werking van de mucosa te onderzoeken, aan de hand van een diepgaande karakterisering van eiwitten die betrokken zijn bij deze essentiële processen. Proteomics (grootschalige eiwitanalyse via massaspectrometrie) biedt diep inzicht in deze processen, maar ontbrak aan robuuste standaarden. Dit project vulde die leemte en maakt voortaan betrouwbare analyse van mucosale eiwitten mogelijk.

Onderzoeksaanpak

Het optimaliseren van de methodologie voor proteomics-gebaseerd onderzoek naar de intestinale mucosa van het varken hield onder meer in: onderzoek en verfijning van zowel de methode van staalname als het protocol voor de staalverwerking. Het gefinaliseerde protocol werd vervolgens toegepast in een experiment dat de effecten van diergenetica en voeder op basis van nevenstroomproducten op het intestinale proteoom van het varken onderzocht. Tijdens en na toepassing werden reproduceerbaarheid, kwaliteitscontrole en standaardisatie expliciet geëvalueerd. De bevindingen onderstrepen dat strikte kwaliteitsborging essentieel blijft, ook bij geoptimaliseerde workflows.

Relevantie/Valorisatie

De ontwikkelde methodologie legt een solide basis voor toekomstig mucosaal proteomics-onderzoek. De inzichten zijn relevant voor de veehouderij én biomedische studies, omdat ze mechanistische kennis over darmgezondheid verdiepen. Ze kunnen precisievoedings- en gezondheidsstrategieën voor varkens ondersteunen, met potentieel voor betere productie-efficiëntie en hoger dierenwelzijn.