Snelle detectiemethoden voor quarantaine Tephritidae

Algemeen kader

Vroege detectie en identificatie van niet-Europese quarantaine Tephritidae soorten (boorvliegen) kan helpen om een ongewenste introductie van deze insecten in ons land te voorkomen. Het in kaart brengen en evalueren van (relatief nieuwe) snelle moleculaire identificatie-methoden voor deze plagen in geïmporteerd fruit en groenten is één van de nuttige resultaten die ILVO-onderzoekers hebben gerealiseerd binnen het Euphresco project TEPHRIFADE, in samenwerking met 19 partners uit 14 landen.  Boorvliegen van de familie Tephritidae behoren tot de meest schadelijke invasieve plaagsoorten in groenten en fruit. Ze veroorzaken aanzienlijke oogstverliezen en vormen wereldwijd een bedreiging voor producenten en handelaars. Het was en is een uitdaging om de beestjes in al hun levensstadia te kunnen identificeren tot op genus- of soortniveau. 

Onderzoeksaanpak

Dankzij dit project bestaat er nu een inventaris van snelle moleculaire methoden voor de identificatie van Tephritidae-soorten, waaronder LAMP, qPCR, soortspecifieke (multiplex) PCR en DNA-barcodering. Daaruit bleek dat de snelle technieken slechts voor een beperkt aantal Tephritidae-soorten beschikbaar waren. De projectpartners wisselden protocollen uit, organiseerden interlaboratorium testen voor de validatie en implementatie van de beste diagnostische protocollen en stelden richtlijnen op om de detectie te harmoniseren. Er werden diagnostische protocollen ontwikkeld voor de moleculaire identificatie van Ceratitis cosyra met behulp van de LAMP-assay en voor Bactrocera cucurbitae met behulp van een Real-Time PCR-assay. Om taxonomische hiaten te identificeren, verzamelden de onderzoekers ook DNA-sequenties uit GenBank en BOLD databases en identificeerden zo respectievelijk 69 en 80 soorten zonder sequentiegegevens in GenBank en BOLD.

Relevantie/Valorisatie

Kennisuitwisselingsevenementen, waaronder een driedaagse trainingsworkshop over HTS (High-Throughput Sequencing) en LAMP, georganiseerd door de NVWA in samenwerking met ILVO en het KMMA, zorgden voor praktische lessen voor projectpartners en externe deelnemers. Een Test Performance Study (TPS) uitgevoerd door ILVO, waaraan 10 internationale laboratoria deelnamen, valideerde de effectiviteit van de ontwikkelde LAMP-test voor C. cosyra. Met het oog op een meer efficiënte onderschepping van de plaaginsecten en een snellere, nauwkeurigere detectie van een uitbraak, is getracht om representatieve exemplaren te verzamelen van soorten waarvan nog geen DNA sequentiegegevens beschikbaar zijn. Helaas zonder succes. Om deze hiaten op te vullen, moeten er nog gerichte verzamelpogingen gebeuren in regio's waar de ontbrekende soorten endemisch zijn.

Financiering
FOD Volksgezondheid, Veiligheid van de voedselketen en Leefmilieu